Le canal de La Balsa est d'une grande importance pour la stabilité du marais de Bajo Sinu, car il contribue au flux et au reflux des eaux de l'ensemble de la zone humide. La végétation de la forêt sèche ou de la plaine alluviale est basse, la mangrove est la végétation prédominante dans la section qui s'approche de l'embouchure du fleuve à environ 2 kilomètres, où l'eau est saumâtre comme celle des marais estuariens. On y trouve la faune typique des mangroves, puisqu'elle abrite des hérons blancs et gris et des canards.
