La dévotion à San José a commencé approximativement en 1700, à cette époque une femme espagnole appelée Catalina Ruíz de Vega vivait à San Antero, une catholique fidèle qui priait la neuvaine chaque 19 mars. Chaque année, elle rassemblait ses serviteurs et aussi la communauté des croyants. De cette façon, la foi dans le saint était encouragée.
Selon les habitants de la région, l'église a été construite de manière archaïque en 1900 et la cloche a été donnée par des étrangers venus sur un bateau de Hollande (Pays-Bas). L'église de San José est située dans le parc principal de Sibundoy et se compose d'une tour principale avec une coupole, de deux petites chapelles et de douze colonnes centrales à l'intérieur.
Elle possède également un autel principal où se trouve une image de Jésus crucifié, de la Vierge Marie, de Saint Joseph et d'autres saints comme Saint Nicolas de Bari et l'Enfant Divin.
